Famakofor
Farmakofor atau pharmacophore
adalah konfigurasi spasial fitur penting yang memugkinkan molekul ligan untuk
berinteraksi dengan reseptor target tertentu. Dengan tidak adanya struktur
reseptor dikenal, farmakofor dapat diidentifikasi dari suatu sel ligan yang
telah diamati untuk berinteraksi dengan reseptor sasaran. Sebuah farmakofor
didefinisikan sebagai susuanan 3D fitur yang sangat penting untuk molekul ligan
untuk berinteraksi dengan reseptor target dalam situs pengikatan tertentu.
Setelah diidentifikasi, farmakofor dapat
berfungsi sebagai model penting untuk screening virtual , terutama dalam
kasus dimana struktur 3D dari reseptor tidak diketahui dan teknik docking yang
tidak berlaku (Dror, et al, 2010). Farmakofor merupakan posisi geometrik tiga
dimensi dari gugus-gugus yang terdapat di dalam suatu ligan yang membentuk
suatu pola yang unik yang dapat dikenali oleh reseptor secara spesifik yang
bertanggung-jawab terhadap proses pengikatan ligan dengan suatu reseptor dan
aktivasi reseptor tersebut (Thomas, 2007).
Pendekatan farmakofor telah
menjadi salah satu alat utama dalam penemuan obat. Berbagai metode berbasis
ligan dan berbasis struktur telah dikembangkan untuk permodelan farmakofor yang
lebih baik dan telah berhasil dan diterapkan luas. Fitur pendekatan farmakofor
ini diharapkan dapat memperkecil waktu dan biaya dalam penemuan dan
perkembangan obat baru. Fitur khas pada farmakofor yaitu : sentral hidrofobik,
cincin aromatik, akseptor atau donor hidrogen, kation dan anion. Titik farmakofer
ini bisa saja terletak pada ligand itu sendiri atau bisa terletak di reseptor.pertanyaan
1. apakah fungsi dari farmakofor ini sendiri ?
2. bagaimana cara mengidentifikasi farmakofor ?
3. apa itu ligan ?
assalamualaikum wr wb
BalasHapussaya ingin menjawab no 3 dr sumber yg saya dpt kan Ligan adalah molekul sederhana yang dalam senyawa kompleks bertindak sebagai donor pasangan elektron (basa Lewis). ligan akan memberikan pasangan elektronnya kepada atom pusat yang menyediakan orbital kosong. interaksi antara ligan dan atom pusat menghasilkan ikatan koordinasi. jenis-jenis ligan ialah monodentat, bidentat dan polidentat
maaf jika sumber saya salah
terimaksh
ya terimakasih atas jawabannya , apakah annisa tau bagaimanakah bentuk dari struktur ligan itu sendiri
Hapussaya akan menambahkan
Hapusligan itu adalah Molekul-molekul atau ion-ion mendonorkan yang elektron-elektron,
biasanya merupakan electron pair.
Hai aida... saya akan coba menjawab no 1.
BalasHapusfungsi menentukan farmokofor :
a. menentukan gugus-gugus penting yang dapat berikatan dengan reseptor
b. menentukan posisi relative 3D gugus-gugus molekul dengan target.
c. bagaimana konformasi aktif dari molekul
d. penting sebagai dasar untuk merancang obat.
e. penting sebagai dasar untuk menemukan obat baru
terimakasih atas jawabannya raras,
Hapusapakah gugus yang berikatan dengan reseptor harus sama strukturnya dengan reseptor itu sendiri ?
no 2, farmakofor dapat diidentifikasi dari suatu sel ligan yang telah diamati untuk berinteraksi dengan reseptor sasaran
BalasHapusya ,jawabannya maqhfira
Hapustapi bagaimana kah bentuk dari sel ligan itu sendiri ?
1. Farmakofor merupakan deskripsi abstrak dari fitur molekul yang penting untuk rekognisi molekul ligan berdasarkan fungsi makromolekul biologisnya. Menurut (IUPAC), framakofor merupakan ensembel fitur sterik dan elektronik yang diperlukan untuk memastikan interaksi supramolekuler interaksi yang optimal dengan struktur biologis target yang spesifik dan untuk memicu atau memblok respon biologisnya
BalasHapusSeperti yg telah dijelaskan pada artikel bahwa farmakofor dapat berfungsi sebagai model penting untuk screening virtual , terutama dalam kasus dimana struktur 3D dari reseptor tidak diketahui dan teknik docking yang tidak berlaku (Dror, et al, 2010).
BalasHapus